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厭氧微生物的分離與培養(yǎng)淺談

一、實驗?zāi)康?nbsp;
掌握Hungate厭氧操作技能,掌握厭氧微生物的培養(yǎng)基配制和厭氧菌的富集、分離和純化方法。 
二、知識背景 
產(chǎn)甲烷菌(Mathanogens)是一類以產(chǎn)生大量甲烷氣體作為能量代謝的終產(chǎn)物的特殊原核微生物,廣泛存在于各種極端厭氧環(huán)境中。作為自然界碳素循環(huán)中厭氧生物處理的**后一個成員,該菌與其它菌群協(xié)同作用,將大量的有機物轉(zhuǎn)化成可再生能源,對自然界中的物質(zhì)循環(huán)及當(dāng)今社會能源危機中的能源替代問題具有極大的推動作用。 
產(chǎn)甲烷菌是一類嚴(yán)格的厭氧細(xì)菌,**今還未發(fā)現(xiàn)產(chǎn)甲烷菌具有超氧化物歧化酶和過氧化氫酶,產(chǎn)甲烷菌不能除去在生命代謝過程中產(chǎn)生的超氧化物、過氧化氫等氧化產(chǎn)物,這些氧化物可損害組成細(xì)胞的大分子,如F420因子,當(dāng)F420處于氧化態(tài)時,即與酶蛋白分離而失活。因此,在對甲烷菌進行分離、培養(yǎng)以及操作過程中必須給予無氧的環(huán)境。 
產(chǎn)甲烷菌廣泛分布于自然界,在淤泥、瘤胃、人和動物的腸道、昆蟲的腸道、濕樹木、地?zé)崛?、深海火山口、水田和海洋的沉積物、沼澤等厭氧環(huán)境中都有產(chǎn)甲烷菌存在。 
三、原理 
產(chǎn)甲烷菌是一類必須生活在厭氧生境下并伴有甲烷產(chǎn)生的古生菌,其形態(tài)和生理、生化特性呈現(xiàn)明顯的多樣性。它生長的氧化還原電位約為-0.33V,一般**適生長溫度為30~40℃,**適pH為6.0~7.2。例如細(xì)胞形態(tài)有球狀、短桿狀、長桿狀、螺旋狀和絲狀等;Gram染色反應(yīng)有陽性、陰性和不定性;產(chǎn)甲烷菌生長需要的營養(yǎng)與其它微生物一樣,需要碳源、氮源、無機鹽、生長因子等。生長所需碳源約有10多種,除CO2外,還有其它一碳化合物(甲酸、甲醇、甲胺等)和二碳化合物(乙酸等);只有當(dāng)產(chǎn)甲烷菌在利用H2作CO2還原劑以產(chǎn)生生物合成所需細(xì)胞物質(zhì),才能利用CO2作電子受體以產(chǎn)生ATP和CH4。 
四、實驗藥品、器材 1、藥品 
NH4Cl、MgCl2·6H2O、K2HPO4、KH2PO4、甲酸鈉、乙酸鈉、胰化酪蛋白、酵母膏、鹽酸半胱氨酸、刃天青、Na2S·9H2O、NaHCO3、氨三乙酸、MgSO4·7H2O、MnSO4·2H2O、NaCl、FeSO4·7H2O、CoSO4·7H2O、CaCl2·2H2O、ZnSO4·7H2O、KAl(SO4)2·12H2O、CuSO4·5H2O、H3BO3、Na2MoO4·2H2O、NiCl2·6H2O、Na2SeO3·5H2O、生物素、葉酸、鹽酸吡哆醇、二水鹽酸硫胺、核黃素、煙酸、D-泛酸鈣、維生素B12、對氨基苯甲酸、硫辛酸。 
2、儀器用具 
裝有分壓表和相應(yīng)高純氣體的氮氣鋼瓶,氫氣鋼瓶,二氧化碳鋼瓶,銅柱和銅柱固定架,高壓滅菌鍋,厭氧管(15mL),厭氧瓶(50mL),異丁烯橡膠塞、光波爐、三角燒瓶(500mL、1000mL)、各種規(guī)格的定量注射器(1mL、2mL、5mL),9#針頭,酒精燈,酒精棉球,水樣取樣器、恒溫水浴鍋、恒溫培養(yǎng)箱,熒光顯微鏡,氣相色譜儀等。3、試劑及配制 
(1)1%Na2S溶液  精確稱取1克Na2S 9H2O置于100mL厭氧瓶中,加入99mL無氧無菌水。 
(2)10% NaHCO3溶液  精確稱取10克NaHCO3置于100mL厭氧瓶中,加入90mL無氧無菌水。 
(3)0.1%的刃天青溶液  精確稱取0.1克刃天青,用無水乙醇適量充分溶解后,用100mL容量瓶定容**100mL。 
4、材料 
厭氧消化器沉積物。 四、實驗方法 
(一)無氧N2、H2、CO2的制備 1、原理 
運用Hungate銅柱除氧系統(tǒng)獲得無氧氣體。銅柱是一個內(nèi)部裝有銅絲(單質(zhì)Cu呈亮黃色,CuO呈黑黃色)的硬質(zhì)玻璃管。銅柱兩端連接膠管,一端連接氣鋼瓶,另一端連接出氣管口。此管的大小為直徑40mm,長約400mm,兩端被加工成漏斗狀,外壁繞有加熱帶。加熱帶通電溫度升**約350℃時,向氧化狀的銅柱通入H2時,H2與CuO中的O2結(jié)合形成H2O,而CuO被還原成了Cu,銅柱內(nèi)的Cu呈現(xiàn)明亮的黃色。當(dāng)來自鋼瓶含有微量O2的N2、CO2、H2通過銅柱時,Cu和氣體中的微量O2化合生成CuO,氣體中微量的氧氣被消耗掉,從出管口出來的則為無氧氣體,而銅柱則由明亮的黃色逐漸變?yōu)楹谏?。?yīng)用無氧氣流驅(qū)趕厭氧管或厭氧瓶中的空氣從而獲得無氧環(huán)境。反復(fù)上述過程,銅柱則可反復(fù)使用。 
2、方法 
(1)打開Hungate銅柱除氧系統(tǒng)的的通氣橡皮管的止水夾子,開啟氫氣鋼瓶并形成氣流,流出的氫氣用橡皮管引出室外,接通電熱套電源,大約20min后,銅柱溫度能達到350℃左右,銅柱內(nèi)的銅絲被氫氣還原,由黃黑色變?yōu)榧冦~錚亮色(CuO+H2   
Cu+H2O),當(dāng)銅柱里面的水蒸氣被排出完全后,可關(guān)閉氫氣鋼瓶,壓力表指針降為零,銅柱還原結(jié)束。用止水夾子將通氣橡皮管密閉待用。 
(2)當(dāng)需要使用無氧氮氣時,打開氮氣鋼瓶,氣流大小以把針頭對準(zhǔn)操作者手背5cm距離明顯感覺到氣流為宜,并隨時注意氣流是否足夠。此時銅柱內(nèi)的銅絲處于還原態(tài)的單質(zhì)銅,當(dāng)通入高純氮(99.999%)時,其中所含的極微量氧與單質(zhì)銅反應(yīng),被固定下來(形成氧化銅),同時柱內(nèi)會產(chǎn)生水蒸氣,氧化銅與氫氣反應(yīng)所致,流出銅柱的則是無氧氮氣。使用完畢后,先關(guān)緊氮氣鋼瓶,使壓力表的指示針回**零位,接著用止水夾封閉所有橡皮管。無氧氫氣、二氧化碳的使用方法相同。 
注意:在進行銅柱還原通氫氣的時候必須打開窗戶,一定熄滅操作臺邊上所有明火,包括酒精燈和電爐,操作室內(nèi)不得有明火(如抽煙、使用火柴、火機等)。 #p#分頁標(biāo)題#e#
(二)無氧無菌水的配制 
1、將500mL一定濃度的NaCl水溶液(防止稀釋時細(xì)胞漲破)沿玻璃棒倒入固定在鐵架臺上的1000mL三角燒瓶中(選擇合適的圓底燒瓶,水不可太滿,否則水沸騰時容易濺出),**好放入幾個防爆玻璃珠。向500mL水中加入終濃度為0.001‰的刃天青(resazurin),即加入0.5mL 的1‰刃天青母液(W/V),并加入0.25g半胱氨酸(L-Cysteine)(終濃度0.5‰)。在燒瓶外壁溶液水平面處劃一刻度后,加入適量水(因為蒸發(fā)會損失部分水分)。煮沸5~10min(視所加水總量而定),刃天青會根據(jù)水中含氧量的下降經(jīng)歷紫色-紅色-無色的顏色變化,當(dāng)溶液變?yōu)闊o色后,再煮沸5min,然后通高純氮氣1-2min(趕走空氣)。 
2、分裝的過程可以不用繼續(xù)加熱,用10mL的定量注射針筒抽進氮氣流,再打出(三次以上)洗氣,然后抽取9mL無氧水注入已換氣的15mL厭氧管中(抽取注射過程中應(yīng)迅速利落,與空氣接觸時間應(yīng)縮****短);注入?yún)捬豕芎?,需要等待通?s~10s,以置換瓶中空氣,在抽出氮氣流針頭的同時塞緊異丁烯橡膠塞(操作要*:抽出針頭時要注意,橡膠塞應(yīng)該先半扣到瓶口,然后用右手食指撳住,左手捏住通氣針頭慢慢抽出針頭,橡膠塞可能會外翻導(dǎo)致漏氣等,此時將針頭往瓶內(nèi)伸使塞子恢復(fù)原樣,有時需要反復(fù)多次,視塞子大小而定,**后拔出針頭,拔出同時立即將塞子塞進管口),**后旋緊蓋子。 
3、上述無氧水經(jīng)121℃高壓蒸汽滅菌20min后則獲得無氧無菌水。 (三)厭氧菌液體培養(yǎng)基配制(以制備1000mL為例)

2、培養(yǎng)基配制方法 
按照配方稱取藥品置于事先放有適量蒸餾水的三角瓶中溶解后,加入1mL的1‰刃天青液(W/V)(終濃度0.001‰),0.4g的半胱氨酸(L-Cysteine)(終濃度0.4‰),用NaOH或KOH調(diào)節(jié)pH值(resazurin和半胱氨酸對培養(yǎng)基的pH有影響,應(yīng)加入后再測pH)加足需要水量,用記號筆在三角瓶外壁標(biāo)上記號,加入一定量的蒸餾水作蒸發(fā)量后,置于光波爐上,加熱煮沸10min后,通入無氧氮氣煮沸**培養(yǎng)基顏色變白后再煮10min左右進行分裝。 
3、分裝 
用9號針頭連接的橡皮管將無氧氮氣引入待裝容器(15mL厭氧管、50mL厭氧瓶)洗瓶,用培養(yǎng)基分液器進行分裝,厭氧管裝4.5mL,厭氧瓶裝45mL,待裝好培養(yǎng)基后取出氮氣管塞上橡膠塞,旋緊蓋子。 
4、滅菌 
厭氧試管用專用布袋裝好后與厭氧瓶一起即可滅菌,121℃濕熱滅菌20min后待用(厭氧瓶使用前加入1%Na2S溶液0.1mL和10%NaHCO30.1mL,厭氧管使用前前加入1%Na2S溶液0.02mL和10%NaHCO30.02mL)。 
(四)厭氧菌固體培養(yǎng)基配制 
在上述液體培養(yǎng)基配方中按每1000mL加20g瓊脂粉即可。方法同上述液體培養(yǎng)基制備。 
(五)甲烷菌富集及滾管分離 1、甲烷菌富集 
用水樣取樣器取沼氣底泥5克于上述裝有45mL的培養(yǎng)基中(厭氧操作),利用亨蓋特厭氧操作系統(tǒng),按氫氣/二氧化碳40/10的比例分別加入氫氣200mL、二氧化碳100mL,25~30℃恒溫培養(yǎng)15~30天。于生長指數(shù)中期進行滾管轉(zhuǎn)移培養(yǎng)。 
2、滾管轉(zhuǎn)移培養(yǎng) 
取裝有的4.5mL固體培養(yǎng)基的待用厭氧管27支,置55℃水浴中融化并保持液態(tài),分別加入1%Na2S溶液0.02mL和10%NaHCO30.02mL。用1mL注射器取富集培養(yǎng)的樣品液0.5mL,作10-1~10-9稀釋,每支試管上下倒2~3次使樣品與培養(yǎng)基充分混勻并立即將稀釋管置于4℃以下的冰水中滾管,使凝固的培養(yǎng)基光滑無氣泡,重復(fù)三次(稀釋時須一針一管,注射器事先用無氧氮氣洗過3次,保證處于無氧狀態(tài))。 
富集滾管培養(yǎng)一般需重復(fù)進行3次。 3、加氣培養(yǎng) 
將接種好的厭氧管置于試管架上,按氫氣/二氧化碳40/10的比例分別加入氫氣40mL、二氧化碳10mL,25~30℃恒溫培養(yǎng)15~30天后,用氣相色譜儀測是否有甲烷氣體產(chǎn)生。對有甲烷氣體產(chǎn)生的管子,置于熒光顯微鏡下觀察,對管壁有熒光的菌落用記號筆畫圈作出記號待進一步分離培養(yǎng)。 
(六)單菌落分離獲取甲烷菌純培養(yǎng)
1、挑菌 
將有熒光的管子置于鐵架臺上固定,打開管口,用無氧氮氣吹入管中是管內(nèi)保持無氧狀態(tài),用無菌的前端彎成直角換過氣的巴氏管子,將有熒光記號的菌落吸出放入有4.5mL培養(yǎng)基(注意事先每支管子加入1%Na2S溶液0.02mL和10%NaHCO30.02mL)的無氧管子中迅速塞上膠塞旋上外蓋。 
2、加氣培養(yǎng) 方法同上。 
通過單菌落分離獲取的菌液經(jīng)培養(yǎng)后底部有沉淀出現(xiàn),用氣相色譜儀檢測管中有無甲烷。對有甲烷的菌管,再進行1~2次滾管分離則可獲得甲烷菌的純培養(yǎng)。將**后分離的菌落挑取進行液態(tài)培養(yǎng)則為待鑒定的純培養(yǎng),一部分在4℃條件下進行保藏,一部分進行觀察鑒定。 
六、注意事項 
1、使用氫氣操作時,實驗室內(nèi)不得有明火,嚴(yán)禁在實驗室內(nèi)吸煙。 2、滾管操作時事先準(zhǔn)備好冰塊和冰水,各稀釋度管子貼上相應(yīng)標(biāo)簽。 3、注射器在使用前必須經(jīng)過121℃、20min滅菌。 七、實驗報告 
撰寫小論文報告分離培養(yǎng)結(jié)果。
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